总体规划借鉴岭南传统生态居住格局，济南三维动画提出“生态簇团、择水而居”的理念，利用现有河网，以莲花湾为中心，沿水体布局商业、休闲及文化交流活动带。
据介绍，规划保留了亚运城现有的所有水系，并且将拓宽现有河道作为水道，利用景观水道形成公共区和选手村的安全分隔，创造赛时封闭管理的亚运城。整体绿化结构可以分为生态公园、生态廊道及各组团绿地。水系的绿化处理上，亚运城内水网河涌景观以桑基鱼塘、荔湾渔家为设计模式，体现岭南珠江三角洲特有的水乡景观。
根据规划，亚运城由运动员村、媒体村、技术官员村、后勤服务区以及亚运公园、体育馆和六大组团构成。其中前四者的总体布局和构思已经基本确定，在具体修建时细节会有所调整。
运动员村：居住区、国际区和公共区
运动员村位于亚运城的中部，为莲花湾以北地块。运动员村分为居住区、济南三维动画国际区和公共区三部分。运动员的居住区是运动员村的核心部分，位于两条南北走向的河涌之间，分为四个独立的组团。居住区规划方案以莲花山地区特有的水溶性低丘陵地貌为蓝本，提取其岛状板块形态为设计元素，运用到规划方案之中。
媒体村：可供10000人住宿
媒体村的首要功能是为约10000名媒体人员提供包括住宿、餐饮、休闲、娱乐等服务，位于亚运城的西部。规划方案把媒体村设置在既与对外交通联系紧密又远离运动员村的位置，其南面有轨道交通四号线的海傍站、公交站场等公交设施，与高速公路联系紧密。
技术官员村：将独立设置制证中心
在亚运会期间技术官员居所为2800名技术官员提供包括住宿、餐饮、休闲娱乐等服务，将独立设置制证中心，济南三维动画并独立设置安检出入口和通道。